Әлем коронавирустың жаңа желісінің таралуын мұқият бақылап отыр. Omicron алғаш рет Ботсванада анықталды, барлық изоляттардың көпшілігі Оңтүстік Африкада алынды. Гонконгта, Канадада, Израильде, Австралияда және бірнеше Еуропа елдерінде импортталған жағдайлар бар, жергілікті инфекциялар дүйсенбіде Шотландия мен Германияда расталды. Ресейде штамм әлі бекітілген жоқ. Оның қасиеттері, белгілері және аурудың ауырлығы туралы не белгілі — РИА Новости материалында.
Омикрон штаммында қандай мутациялар бар?
SARS-CoV-2-нің бұл нұсқасын 22 қарашада Оңтүстік Африка инновациялар және эпидемияға қарсы әрекет ету орталығының ғалымдары жеке зертханалармен бірлесіп ашты. Алғашқы шифрланған үлгілер GISAID қоғамдық дерекқорына жүктелді, онда олар бірден Гонконгта Оңтүстік Африкадан келген пациенттен ұқсас изолятты тапты. Вирустың геномында алпыстан астам мутация болды, оның 32-сі масақ ақуызында. Мамандардың назарын аударған да осы.
Масақ протеині немесе масақ ақуызы вирустық бөлшектің бетінде орналасқан. Оның көмегімен патоген адамның жасушалық қабығына еніп, көбейе бастайды. Сондай-ақ, масақ протеині дененің иммундық реакциясын тудыруы маңызды — барлық қолданыстағы вакциналар оған бағытталған. Бұл генетиктер өзгерістерді мұқият қадағалайтын коронавирустың негізгі бөлігі.
SARS-CoV-2 адамдарға оңай жұқтырады, оның пандемия тудыруы бекер емес. Оның эволюциясының шыңы рекордтық таралу жылдамдығы бар «дельта» болып саналады. Дегенмен, бір-бірімен байланысы жоқ гипермутант ешкімді таң қалдырмады.
Бірнеше күн ішінде ДДҰ оған B.1.1.529 сәйкестендіру нөмірін берді, оны жеке жолға — «омикронға» бөлді және оны алаңдататын нұсқалар тізіміне қосты.
Омикрондағы өзгерістердің көпшілігі ғалымдарға белгілі. Мысалы, альфа және эта сызықтарында 69 және 70 позицияларында делеция, яғни аминқышқылдарының жоғалуы бар. Және бірнеше мутация аймақтағы «қайшы» масақ протеинін екі пептидтік тізбекке (фурин алаңы) кесу үшін кодталған. Екі алмастыру — Q498R және N501Y — жасуша мембранасымен байланысуға көмектеседі. Мұның бәрі жұқпалы ауруларды күшейтеді.
Сондай-ақ вирустың туа біткен иммунитеттен шығуына теориялық тұрғыдан көмектесетін және оның жасуша ішінде көбеюін жеделдететін мутациялар бар, бұл жұқтырған денеде вирустық жүктеменің жоғарылауына әкеледі.
Омикрон штаммының таралуы
Омикрон ауруының көпшілігі Оңтүстік Африканың Гаутенг провинциясында кездеседі. Оның үстіне, ол «дельтаны» ығыстырып шығарды: ол зерттелген үлгілердің 76 пайызын құрайды. Алайда билік қараша айында аздаған геномдар декодталғанын ескертеді, сондықтан нәтиже жақын арада өзгереді.
Қазір Оңтүстік Африкада COVID-19 төртінші толқыны күтілуде. Ауру көбеюде. Мәселен, 29 қарашада 2273 науқас тіркелді. Барлық ПТР сынақтарының шамамен он пайызы оң. Жаңа штамм кінәлі ме, белгісіз.
Ауруханаларда ауыр науқастар көбейіп барады. Серпінді инфекциялар бар, балалар да ауруханаға жатқызылады. Осы уақытқа дейін күніне 25 адам қайтыс болды. Бір түсіндірме, өлім-жітім әрқашан ауруханаға жатқызу деңгейінен екі-үш аптаға артта қалады. Сонымен қатар, Оңтүстік Африка жазда дельта штаммының күшті толқынын бастан кешірді және ауырғандардың кросс-иммунитеті пайда болуы мүмкін.
Omicron-штамм қазірдің өзінде Гонконгта, Австралияда, Канадада, Израильде, кейбір ЕО елдерінде, негізінен Оңтүстік Африкадан оралған туристер арасында. Жұма күні Голландияда Амстердамға келген 13 адам (61 адам) жұқтырған. Дүйсенбіде алғашқы жағдайларды Испания, Франция және Жапония билігі хабарлады.
Ковид індеті қазір орын алған Саксонияда (Германия) шетелде болмаған және келушілермен байланыста болмаған 39 жастағы ер адамда жаңа нұсқа табылды. Сондай-ақ Шотландияда «омикронмен» алты жергілікті инфекция табылды. Бұл штамм осы елдердің ішінде біраз уақытқа дейін айналады дегенді білдіреді.
Жаңа гипермутант қайдан пайда болды?
B.1.1.529 шығу орны мен уақыты әлі анықталған жоқ, бірақ оның эволюциясын қадағалау уақыт талабы. Жұмыс гипотезасына сәйкес, штамм иммун тапшылығы бар адам ағзасында көптеген мутацияларға ие болуы мүмкін.
Иммунитеті әлсіреген адамның денесінен инфекция айлар бойы қарсылыққа тап болмай кетпейтіні белгілі. Мәселен, шілдеде ресейлік ғалымдар қанында 318 күн бойы ковид қоздырғышы айналып тұрған науқас туралы айтып берді. Осы уақыт ішінде вирус еркін дамиды, ал егер пациент оқшауланбаса, инфекция сөзсіз дерлік.
ВИЧ-инфекциясы бойынша Оңтүстік Африка көш бастап тұр. «Оңтүстік Африкада жаңа нұсқаның табылғаны таңқаларлық емес», — деді Адриан Рурен, Ұлттық жұқпалы аурулар институтының (NICD) атқарушы директоры. Бір жыл бұрын дәл сол жерде «бета» желісі пайда болды.
Вакцинолог, Витватерсранд университетінің профессоры Шабир Мади қорытынды жасауға асықпауды ұсынады. Дүйсенбіде Mail & Guardian жергілікті басылымы өткізген вебинарда ол Египеттен оралған және Африканың оңтүстігіне бармаған туристтен Бельгиядағы омикронның импорттық жағдайына назар аударды. «Оның Ботсвана мен Оңтүстік Африкадан табылғаны оның сонда пайда болғанын білдірмейді», — дейді ғалым.